大使館の経済成長・輸出促進部は、日本における「Sistema Italia（イタリア・システム）」の各機関・組織、すなわち在大阪イタリア総領事館、東京のイタリア大使館貿易促進部（ICE）、在東京イタリア銀行代表事務所、東京のイタリア政府観光局（ENIT）、および在日イタリア商工会議所と緊密に連携しながら活動しています。
2019年2月1日より、欧州連合（EU）と日本との間の経済連携協定（EPA）が発効しています。大使館は、駐日欧州連合代表部が主導するEU加盟国間の連携・調整にも参加しています。
また、日欧産業協力センター（EU-Japan Centre for Industrial Cooperation）の活動も重要な役割を果たしています。「EU Business in Japan」のウェブサイトでは、日本市場において欧州企業に開かれるビジネス機会に関する最新情報をご覧いただけます。